El Programa de Bioingeniería de la Universidad Santiago de Cali está articulado a los lineamientos curriculares y pedagógicos establecidos por la Universidad, se sustenta sobre los siguientes principios de formación:

• Pertinencia: El programa de Bioingeniería propone una estructura curricular relacionada con las necesidades de su campo de acción determinado en la región, específicamente en el desarrollo de procesos biomédicos y ambientales en las diferentes actividades económicas de la región.
• Flexibilidad: El programa de Bioingeniería cuenta con jornada mixta, lo que le permite al estudiante matricular cursos en diferentes horarios de acuerdo a sus necesidades, con una oferta amplia en su matrícula académica, el cual incluye cursos presenciales y virtuales, así como cursos extracurriculares y electivos internacionales homologables.
• Movilidad: El plan de estudios propuesto por el programa de Bioingeniería, permite realizar movilidad a otros programas académicos de la institución, dado el componente general que lo constituye. El programa comparte cursos comunes con otros programas de la facultad, alcanzando el 50% de cursos que desarrolla en común, facilitando la interacción de los diferentes programas y permitiendo el desarrollo de proyectos con miradas desde las diferentes disciplinas.
• Actitud investigativa: El programa en su Plan de estudios le apuesta a la investigación formativa orientada en los cursos del campo de investigación, los cuales se articulan a través de semilleros, líneas y grupos de investigación. De igual forma desde cada curso disciplinar se busca orientar al estudiante a la práctica de indagación de acuerdo a la temática que se desarrolla.
• Interdisciplinariedad: Desde el programa de Bioingeniería se promueve formación orientada a enfrentar diferentes problemáticas en su campo de acción, para un consecuente aprendizaje, esto se propone en cursos como proyecto integrador básico en el que confluyen estudiantes de diferentes programas de la facultad y buscan dar solución desde su perfil académico, aunando esfuerzos y generando conocimientos.
• Internacionalización: el plan de estudios del programa de Bioingeniería promueve el desarrollo de contenidos académicos y del idioma inglés, que se articulan a otros programas de universidades locales, nacionales e internacionales así como centros de investigación que facilitan el desarrollo de trabajos en común, todo esto como una apuesta internacional del programa.
• Autoformación: el programa en el proceso de formación académica contempla el desarrollo de trabajo independiente, acompañado de la asesoría del profesor así como la disponibilidad de un conjunto de bases de datos e infraestructura de laboratorios que le permite fortalecer su conocimiento.
• Integralidad: el programa de Bioingeniería promueve la formación integral a través del conocimiento científico y tecnológico, articulado a principios éticos que lo faculte como un ciudadano de bien, dispuesto a contribuir al mejoramiento de la calidad de vida y al desarrollo sostenible.